福州市仓山小学创办于1952年3月，原名福建军区干部子弟学校，后更名为福州军区干部子弟学校，隶属福州军区干部部管理。校址：南台岛仓山区立新路25号。建国以前，这里曾办过日本儿童小学和福建省国立音乐专科学校。
建校初期，学校按部队团级编制。校部设教导处、总务处，教职工40余人，学校教育经费由军区干部福利费项目开支，教工享受供给制待遇。生源主要为军队团级以上干部子女。
1965年学校移交地方管理，校名改为福州市仓山小学。文革期间曾名红卫兵小学，1979年恢复为仓山小学。并经省教育厅审定为首批办好的省重点小学之一。1994年定为福建省小学名校。2003年以高分通过福建省示范小学评估。2006年又以高分通过福建省示范小学复评。
校部设教导处、总务处，教职工40余人，学校教育经费由军区干部福利费项目开支，教工享受供给制待遇。生源主要为军队团级以上干部子女。